Нажмите на эту строку чтобы перейти к Новостям сайта "Русский врач"

Перейти
на сайт
журнала
"Врач"
Перейти на сайт журнала "Медицинская сестра"
Перейти на сайт журнала "Фармация"
Перейти на сайт журнала "Молекулярная медицина"
Перейти на сайт журнала "Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии"

МИКОБИОТА КАК ЧАСТЬ МИКРОБИОТЫ: ОСОБЕННОСТИ МЕТОДОВ ИЗУЧЕНИЯ НА СОВРЕМЕННОМ ЭТАПЕ

DOI: https://doi.org/10.29296/25877313-2019-11-01
Скачать статью в PDF
Номер журнала: 
11
Год издания: 
2019

Н.С. Багирова д.м.н., вед. науч. сотрудник, микробиологическая лаборатория, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» МЗ РФ (Москва) E-mail: nbagirova@mail.ru Н.В. Дмитриева д.м.н., профессор, зав. микробиологической лабораторией, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» МЗ РФ (Москва) E-mail: prof.ndmitrieva@mail.ru И.Н. Петухова д.м.н., вед. науч. сотрудник, микробиологическая лаборатория, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» МЗ РФ (Москва) E-mail: irinapet@list.ru З.В. Григорьевская д.м.н., вед. науч. сотрудник, микробиологическая лаборатория, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» МЗ РФ (Москва) E-mail: izlatadoc@list.ru И.В. Терещенко мл. науч. сотрудник, микробиологическая лаборатория, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» МЗ РФ (Москва) E-mail: in.ter68@inbox.ru

Цель работы – обратить внимание исследователей, работающих в области изучения микробиоты/микробиома, на особенности планирования исследования. Важно применять наиболее современные методы получения биоматериала и методы их дальнейшего исследования. Стандартизация подобных исследований необходима для получения результатов, которые должны быть сопоставимы с прочими исследованиями в этой области. Корректное формирование дизайна будущего исследования определяет реперзентативность полученных результатов. Сегодня большинство исследований в основном сконцентрировано на изучении бактериального компонента кишечной микробиоты человека, при этом не учитывается ее грибковый компонент. Исследование кишечной микобиоты, которая относится к разнообразному множеству грибных видов, является относительно новой и быстро прогрессирующей областью изучения. Несмотря на вездесущность и численность грибов, населяющих кишечник человека, их совокупность на несколько порядков меньше, чем бактерий. Недавние исследования показали, что микобиота может быть тесно связана со здоровьем и болезнями. Грибковые сообщества не только изменяются при заболевании, но также играют роль в поддержании гомеостаза того или иного локуса тела человека, во влиянии на системный иммунитет. Кроме того, широко распространено мнение, что ассоциации грибов разных видов в организме хозяина, ассоциации бактерий и грибов имеют решающее значение для здоровья хозяина. Однако менее 0,4% литературы посвящены изучению микобиоты и микобиома. Механизмы, с помощью которых грибы взаимодействуют с другими компонентами микробиома и хозяина, остаются плохо охарактеризованными. Результаты научных исследований, которые проводятся с этой целью, нередко противоречивы, и возникают сложности при попытке сопоставить данные. Исследователи применяют разные методы получения материала, разные методы изучения его состава, обследуют разнородные группы больных (различные географические регионы, без первичного лечения, с лечением, разные стадии болезни и проч.), часто малой выборки. В настоящее время полноценное изучение микобиома возможно только при многогранном и междисциплинарном подходе. Чрезвычайно интересной областью изучения является функциональность различных видов грибов, включая то, как они взаимодействуют с другими эукариотами и прокариотами, присутствующими в различных локусах тела человека. Предстоит выяснить, что более важно, как эти взаимодействия влияют на нас.

Ключевые слова: 
микобиом
микробиом
микобиота
микробиота
бактериом
Для цитирования: 
Багирова Н.С., Дмитриева Н.В., Петухова И.Н., Григорьевская З.В., Терещенко И.В МИКОБИОТА КАК ЧАСТЬ МИКРОБИОТЫ: ОСОБЕННОСТИ МЕТОДОВ ИЗУЧЕНИЯ НА СОВРЕМЕННОМ ЭТАПЕ . Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии, 2019; (11): -https://doi.org/10.29296/25877313-2019-11-01

It appears your Web browser is not configured to display PDF files. Download adobe Acrobat или click here to download the PDF file.

Список литературы: 
  1. Methe´ B.A., Nelson K.E., Pop M., Creasy H.H., Giglio M.G., Huttenhower C. et al. (248 collaborators: https://www.ncbi.
  2. nlm.nih.gov/pubmed/22699610). Human Microbiome Project Consortium.). A framework for human microbiome research // Nature. 2012; 486, 7402: 215–221. doi:10.1038/nature11209.
  3. Gillevet P.M., Sikaroodi M., Torzilli A.P. Analyzing salt-marsh fungal diversity: comparing ARISA fingerprinting with clone sequencing and pyrosequencing // Fungal Ecol. 2009; 2, 4: 160–167. doi: 10.1016/j.funeco. 2009.04.001.
  4. Forbes J.D., Bernstein C.N., Tremlett H., Van Domselaar G., Knox N.C. A Fungal World: Could the Gut Mycobiome Be Involved in Neurological Disease? // Front. Microbiol. 2019; 9: 3249. doi: 10.3389/fmicb. 2018.03249.
  5. Hernández-Santos N., Klein B.S. Through the scope darkly: the gut mycobiome comes into focus // Cell Host. Microbe. 2017; 22, 6: 728–729. doi: 10.1016/j.chom.2017.11.013.
  6. Huseyin C.E., O’Toole P.W., Cotter P.D., Scanlan P.D. Forgotten fungi - the gut mycobiome in human health and disease // FEMS Microbiol. Rev. 2017; 41, 4: 479–511. doi: 10.1093/femsre/fuw047.
  7. Griffith G.W., Ozkose E., Theodorou M., Davies D.R. Diversity of anaerobic fungal populations in cattle revealed by selective enrichment culture using different carbon sources // Fungal Ecol. 2009; 2: 87–97. doi: 10.1016/j.funeco. 2009.01.005.
  8. Chen Y., Chen Z., Guo R., Chen N., Lu H., Huang S., Wang J., Li L. Correlation between gastrointestinal fungi and varying degrees of chronic hepatitis B virus infection // Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 2011; 70, 4: 492–498. doi: 10.1016/j.diagmicrobio. 2010.04.005.
  9. Hamad I., Sokhna C., Raoult D., Bittar F. Molecular detection of eukaryotes in a single human stool sample from Senegal // PLoS One. 2012; 7, 7: e40888. doi: 10.1371/journal.pone.0040888.
  10. Gouba N., Raoult D., Drancourt M. Plant and fungal diversity in gut microbiota as revealed by molecular and culture investigations // PLoS One 2013; 8, 3: e59474. doi:10.1371/journal.pone.0059474.
  11. Proal A.D., Albert P.J., Marshall T.G. Autoimmunity, and Vitamin D. CHAPTER 10 in «Infection and Autoimmunity», Second Edition. Edited by Yehuda Shoenfeld, Nancy Agmon-Levin, Noel R. Rose; p.163-182, Elsevier B.V, 2015. http://dx.doi.org/10.1016/B978-0-444-63269-2.00007-6.
  12. Hall R.A., Noverr M.C. Fungal interactions with the human host: exploring the spectrum of symbiosis // Curr. Opinion Microbiol. 2017; 40: 58–64. http://dx.doi.org/10.1016/j.mib. 2017.10.020.
  13. Толкачев О.Н., Яхонтова Л.Д., Романенко Е.А., Фирсова Г.А., Мазаева В.Г., Седакова Л.А. Результаты предварительного изучения противоопухолевой активности моноэфирных бисбензилизохинолиновых алкалоидов ряда магнолина-магноламина // В сб. «Химиотерапия опухолей в СССР». М.: ОНЦ АМН СССР. 1977. Вып. 23–24. С. 117–121.
  14. Бережинская В.В., Никитина С.С., Трутнева Е.А. Противовоспалительные свойства алкалоидов тетрандрина, циклеанина и даурицина // Лекарственные растения. Фармакология и химиотерапия. Труды ВИЛАР. М.: Колос. 1971. Т. 14. С. 43–58.
  15. Бережинская В.В., Никитина С.С. О противовоспалительном эффекте тетрандрина, и некоторых сторонах его механизме действия // Фармакология и токсикология. 1965. № 1. С. 77–81.
  16. Никитина С.С., Трутнева Е.А. К фармакологии алкалоида циклеанина // Фармакология и токсикология. 1967.
  17. Т. 30. № 3. С. 332–334.
  18. Kupchan S.M., Liepa A.J., Baxter R.L., Hintz H.P.J. New alkaloids and re-lated artifacts from Cyclea peltata // J. Org. Chem. 1973. V. 38. № 10. P. 1846–1852. (
  19. Kupchan S.M., Altland H.W. Tu-mor inhibitors. 89. Structural require-ments for tumor-inhibitory activity among bisbenzylisiquinoline alkaloids and related compounds // J. Medic. Chem. 1973. V. 16. № 8. P. 913–917.
  20. Tolkachev O.N., Yakhontova L.D., Romanenko E.A., Firsova G.A., Mazaeva V.G., Sedakova L.A., Sof’ina Z.P. The structure– antitumor activity of some bisbenzylisoquinoline alkaloids [Report, In: Consultation on Potentials for Use of Plants Indicated by Traditional Medicine in Cancer Therapy. WHO. Geneva. 13–17 November 1978. WP 7 (7 P.).
  21. Толкачев О.Н., Яхонтова Л.Д., Романенко Е.А., Фирсова Г.А., Мазаева В.Г., Седакова Л.А., Софьина З.П. Противоопухолевая активность некоторых бифункциональных алкалоидов и их производных // Тезисы докладов Всесоюз. науч. конф. «Синтез и изучение новых отечественных противолейкозных препаратов». Вильнюс. 1979. С. 81.
  22. Tolkachev O.N., Firsova G.A., Mazaeva V.G., Sedakova L.A., Roma-nenko E.A. Structure–Activity relation-ship study of the bisbenzylisoquinoline alkaloids // 9th NCI-EORT Symposium on New Drugs in Cancer Therapy. Am-sterdam, Netherland. March 12–15 1996 // In: «Drug design, synthesis, acquisi-tion and structure activity relation-ships». Downloaded from annonc. Ox-ford Journals Org. at State Public Li-brary for Science and Technology on May 29. 2010. P. 108.
  23. Дуплищева А.П., Синилова Н.Г., Толкачев О.Н., Яхонтова Л.Д. Изучение влияния некоторых алкалоидов на неспецифическую резистентность к инфекции // Сб. науч. трудов «Химия, технология, медицина». Материалы Междунар. конф., посвящ. 75-летию ВИЛАР. М. 27–29 июня 2006. Т. XVII. С. 106–109.
  24. Barot V.M.R., Chang-Jung-Iieh, Farnsworth N.R., Forbes A., Guerra F., Han-Jui, Marini-Bettolo G.B., Natori S., Olweny C.L.M., Tella A., Tolkachev O.N. (Rep.), The structure–antitumor activity of some bisbenzylisoquinoline alkaloids // In: «Consultations on Potentials for Use of Plants Indicated by Traditional Medicine in Cancer Therapy». World Health Organization. Can/TRM/79.1, Geneva. 13–17 November 1978. Р. 8 (20).
  25. Толкачев О.Н. Исследования в области 1-бензилизохинолиновых, бисбензилизохинолиновых и родственных алкалоидов: Автореф. дисс. … докт. хим. наук. М.: МИТХТ. 1982. 369 с. Автореферат диссертации, докт. хим. наук, Москва, МИТХТ. 1982. 50 с.
  26. Толкачев О.Н., Сыркин А.Б. Молекулярные основы противоопухолевой активности бифункциональных алкалоидов // Первый съезд онкологов стран СНГ. 3–6 декабря 1996. М. Часть 1. С. 60.
  27. Толкачев О.Н., Вичканова С.А., Макарова Л.В., Найдович Л.П. Зависимость туберкулостатической активности бисбензилизохинолиновых алкалоидов от их структуры // Фармация. 1978. Т. 27. № 2. С. 23–26.
  28. Mitscher L.A., Wu W.-N., Doskotch R.W., Janes J., Beal J.L. Antibiotics from higher plants. Thalictrum rugosum // J. Chem. Soc. Chem. Commun. 1971. № 11. P. 589–590.
  29. Mitscher L.A., Wu W.-N., Doskotch R.W., Janes J., Beal J.L. Antimicrobial agents from higher plants. II. Alkaloids from Thalictrum rugosum // Lloidia. 1972. V. 35. № 2. P. 167–176.
  30. Zuguang Ye, Knox Van Dyke, An-timalarial activity of various bisbenzyli-soquinoline and aporphine-benzylisoquinoline alkaloids and their structure-activity relationships against chloroquine–sensitive and resistant Plasmodium falciparum Malaria in vitro // Malaria Control & Elimination. 2015. V. 5.
  31. № 1. P. 1–7.
  32. Ye Z. & Dyke K.V. Antimalarial ac-tivity of various bisbenzylisoquinoline and aporphine alkaloids and their struc-ture-activity relationships against chlorochine sensitive and resistant plasmodium falciparum malaria in vitro // Malaria Contr. Elimination. 2015.V. 4. P. 137–147.
  33. Толкачев О.Н. Природные диариловые эфиры // Химия природных соединений. 1981. № 3. С. 263–283.
  34. Вичканова С.А., Толкачев О.Н., Адгина В.В., Изосимова С.В., Горюнова Л.В., Шипулина Л.Д. Взаимосвязь между структурой и антимикробной активностью замещенных ω-нитростиролов // Фармакология и токсикология. 1975. Т. 38. № 1. С. 71–77.
  35. Рубинчик М.А., Толкачев О.Н. Изучение антипротозойной активности соединений ряда дифениловых эфиров и некоторых нитростиролов // Медицинская паразитология и паразитарные болезни. 1976. Т. 45. № 5. С. 531–536.
  36. Вичканова С.А., Толкачев О.Н., Макарова Л.В., Цизин Ю.С. Структура и противотуберкулезная активность некоторых дифениловых эфиров // Фармакология и токсикология. 1974. Т. 37, № 6. С. 711–715.
  37. Туманян М.А., Дуплищева А.П., Синилова Н.Г., Кирилличева Г.Б., Соловьева М.С., Толкачев О.Н. Иммуностимулирующее средство (глауцина гидрохлорид) // Патент
  38. № 2032403 (РФ), 10.04.1995 по заявке № 4669907/14, приор. 30.03.1989. Бюл. № 10.